Слово «ковчег» имеет разные этимологии в зависимости от контекста. Термин может относиться к разным понятиям: в христианстве, иудаизме или египтологии.

Слово «ковчег» происходит от старославянского «ковчегъ», которое обозначает «упаковка», «коробка» или «сундучок».
В греческом переводе Библии для обозначения ковчега используется слово κιβωτόν (киботос, в современном греческом — кивотос). Оно означает «коробка», но не простая, а особая...
В христианстве «ковчег» может обозначать:
общее название предметов церковного обихода, служащих вместилищем культовых реликвий;
ларец или сосуд для хранения ценных предметов (в церкви — предметов, относящихся к обряду причастия).
В иудаизме
Древнееврейское слово, которое традиционно переводится на русский язык как «ковчег», обозначает «вместилище, ящик», а также «гроб, саркофаг».
В Библии слово «ковчег» может обозначать:
Ковчег Завета — ящик для хранения скрижалей. Еврейское слово могло также значить «сундук», «ящик» или «гроб».
Ноев ковчег — слово «та-ва», которое обозначает коробку или корзинку.
В египтологии
Слово «ковчег» происходит от древнеегипетского слова, которое обозначало коробку, но не простую, а предназначенную для человека — типа гроба, саркофага или корзины для младенца.
Таким образом, в русском языке слово «ковчег» имеет монгольские корни по звучанию и древнеегипетские оттенки по смыслу